VIII Konferencja Polskiego Towarzystwa Metabolomicznego

Warsztaty i rejestracja na warsztaty (w języku polskim)

Warsztaty i szkolenia będą odbywały się w dniu 17 listopada. Warunkiem uczestnictwa jest wcześniejsza rejestracja, która niebawem zostanie uruchomiona.

Szkolenie z „R” (4 godziny lekcyjne) (w języku polskim)

Prowadzący – prof. dr hab. n. farm. Łukasz Komsta (Uniwersytet Medyczny w Lublinie, Lublin)

Liczba miejsc jest limitowana i w przypadku tego warsztatu wynosi 20. O możliwości uczestnictwa decyduje kolejność zgłoszeń.

1) Środowiska R/Rstudio jako narzędzia pracy i języki programowania: Struktury danych w R. Funkcje operujące na wektorach. Zastosowanie wektorowości środowiska w praktyce. Elementy programowania strukturalnego i obiektowego: tworzenie własnych funkcji, zastosowanie do automatyzacji obliczeń. Tworzenie wykresów w R i techniki wizualizacji danych z użyciem wbudowanego środowiska oraz pakietu ggplot2. Tworzenie raportów w RStudio z zastosowaniem knitr i markdown – reproducible research.

2) Praktyczna analiza danych i modelowanie w R/Rstudio: Analiza rozkładu danych. Parametryczne i nieparametryczne testy statystyczne. Analiza współzależności między zmiennymi oraz jej istotności: współczynniki korelacji Pearsona, Spearmana, Kendalla, macierz korelacji, najczęściej stosowane testy statystyczne. Wprowadzenie do regresji: teoria budowy modelu, algorytmy liniowe i nieliniowe, praktyczna budowa modeli, diagnostyka modeli regresji. Wielowymiarowa analiza danych i regresja wieloraka: analiza głównych składowych, analiza skupień, cząstkowa regresja najmniejszych kwadratów jako narzędzie do analizy danych i modelowania.

Cyclic IMS – Revolutionising metabolomics (w języku angielskim)

Warsztat w imieniu Waters poprowadzą Susan Slade, Jonathan Fox i Jakub Ujma. Warsztat będzie prowadzony w języku angielskim. Więcej informacji na temat prezentowanych treści można przeczytać tutaj.

Taking Lipid Profiling to the next dimension using timsTOF Pro 2 (w języku angielskim)

The profiling of lipids from lipophilic extracts helps to get a deeper understanding in the emergence and progression of many diseases. But this application comes with several challenges like co-eluting isomeric / isobaric lipids or overlapping isotopic patterns. The acquisition of mobility-enhanced data using PASEF on timsTOF Pro 2 enhances the coverage and quality of the data – and with this the total number of compounds that can be annotated.

How easy is it to set up such a lipid profiling project and how do I process the data in MetaboScape software if I want to get standardized high-quality reporting of the annotations?

If you want to learn more about Brukers’ lipid profiling workflow, join us at our virtual demo where we demonstrate the whole workflow from the sample to result.